उन्होंने भारत को "हिंदू राष्ट्र" में बदलने के विचार को खारिज करते हुए जोर देकर कहा कि जब भारत एक धर्मनिरपेक्ष संविधान वाला एक धर्मनिरपेक्ष देश है तो राजनीतिक रूप से खुले दिमाग की जरूरत है।
फैजाबाद लोकसभा सीट जहां राम मंदिर का निर्माण हुआ था, वहां भाजपा की हार के बारे में डॉ सेन ने सत्तारूढ़ दल पर देश की असली पहचान को खत्म करने का आरोप लगाया। उन्होंने कहा "...इतना पैसा खर्च करके राम मंदिर का निर्माण किया गया, सिर्फ भारत को 'हिंदू राष्ट्र' के रूप में चित्रित करने के लिए। महात्मा गांधी, रवींद्रनाथ टैगोर और नेताजी सुभाष चंद्र बोस के देश में यह नहीं होना चाहिए था। उन्होंने कहा, ''भारत की असली पहचान की उपेक्षा नहीं की जा सकती। नजरिया बदलना होगा।''
इस महान अर्थशास्त्री ने अपने बचपन के दिनों को याद करते हुए बताया कि जब भारत ब्रिटिश शासन के अधीन था और लोगों को बिना मुकदमे के जेल में डाल दिया जाता था। उन्होंने कहा- “जब मैं छोटा था, मेरे कई चाचाओं और चचेरे भाइयों को बिना मुकदमा चलाए जेल में डाल दिया गया था। हमें उम्मीद थी कि आजादी के बाद भारत इससे मुक्त हो जायेगा। यह नहीं रुका इसके लिए कांग्रेस भी दोषी है। उन्होंने इसे नहीं बदला... लेकिन, वर्तमान सरकार के तहत यह अब अधिक चलन में है।'' डॉ सेन ने यह बात उन राजनीतिक कैदियों के बारे में सांकेतिक रूप से कही जो शाहीनबाग आंदोलन के दौरान गिरफ्तार करके जेल में डाल दिए गए और उन्हें जमानत भी नहीं मिल रही है। उमर खालिद, शरजील इमाम, खालिद सैफी जैसे सैकड़ों युवा, छात्र जेलों में हैं। देश में 3 आपराधिक कानून 1 जुलाई से लागू हो रहे हैं, ये हालात को और खराब करेंगे।